Orsakerna kan vara att akvariet inte är rätt skött men också att akvariet är nyinrett. I båda fallen är det en biologisk obalans. I ett nytt akvarium har det inte hunnits bildats någon medan i ett missköt är balansen störd. Bottenmaterialet kan vara för kompakt så att det hindrar mikroorganiskenras nedbrytning. Det kan finnas för lite syre som en följd av att man för sällan gjort ett delvattenbyte. Även ett igenslammat filter kan bidra.
För att bli av med algerna kan man göra regelbundna delvattenbyten och samtidigt suga bort algbeläggningen med en slang. Det är ingen bra idé att använda ett algbekämpningsmedel utan att först förbättra skötseln av akvariet. Algbekämpningsmedel försämrar inte bara algernas levnadsvillkor utan också växternas och fiskarnas.